Illumina公司開發的HiSeq 2500高通量測序平臺，擁有高通量運行和快速運行兩種模式，提供多種讀長選擇，也可使用一個或兩個流動槽，使之成為一個靈活且可擴展的平臺。高產量模式沿用HiSeq 2000的運行方式，單次運行可以產出600G，特別適合樣品量較多，或需要最深度覆蓋的應用。快速運行模式最多能在一天之內產生100G左右的數據量，還能提供2×150 bp的讀長，有助于改善de novo應用的組裝效果。
平臺概況
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高通量運行模式* |
快速運行模式* |
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讀長 |
雙流動槽（僅適用于HiSeq 2500） |
單流動槽（HiSeq 1500或2500） |
雙流動槽運行時間 |
雙流動槽（僅適用于HiSeq 2500） |
單流動槽（HiSeq 1500或2500） |
雙流動槽運行時間 |
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1×36 |
95-105 Gb |
47-52 Gb |
2天 |
18-22 Gb |
9-11 Gb |
7小時 |
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2×50 |
270-300 Gb |
135-150 Gb |
5.5天 |
50-60 Gb |
25-30 Gb |
16小時 |
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2×100 |
540-600 Gb |
270-300 Gb |
11天 |
100-120 Gb |
50-60 Gb |
27小時 |
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2×150 |
N/A |
N/A |
N/A |
150-180 Gb |
75-90 Gb |
40小時 |
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通過過濾的讀取 |
最多30億個單端讀取或60億個末端配對讀取 |
最多15億個單端讀取或30億個末端配對讀取 |
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最多6億個單端讀取或12億個末端配對讀取 |
最多3億個單端讀取或6億個末端配對讀取 |
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質量 |
在2 x 50時，≥ 85%的堿基高于Q30 在2 x 100時，≥80%的堿基高于Q30 |
在2 x 50時，≥85%的堿基高于Q30 在2 x 100時，≥80%的堿基高于Q30 在2 x 150時，≥75%的堿基高于Q30 |
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應用：基因組de novo測序、 基因組重測序、 轉錄組測序、 小RNA測序、ChIP-Seq測序、甲基化測序 |
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