Illumina公司開發的MiSeq測序儀，它是Illumina公司于2011年2月推出的小型測序平臺，是一臺內置簇生成和數據產生的測序儀，具有測序速度快，數據準確的優點，可實現300bp×2的測序長度，具備革命性的便捷流程。
性能參數：
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讀長 |
時間 |
總數據量 |
Q30 |
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1×36 |
~4hrs |
540-610 Mb |
﹥90% |
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2×150 |
~24 hrs |
4.5-5.1 Gb |
﹥80% |
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2×250 |
~39 hrs |
7.5-8.5 Gb |
﹥75% |
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2×300 |
~65 hrs |
13.2-15 Gb |
﹥70% |
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應用：微生物多樣性分析、宏基因組測序、轉錄組de novo測序、微生物基因組測序、小RNA測序、表達譜、ChIP-Seq |
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